Escuela Universitaria de Informática "Tomàs Cerdà" (UAB)

Postgrado en Bioinformática: herramientas computacionales en informática médica, ciencias ómicas y diseño de nuevos fármacos

Escuela Universitaria de Informática "Tomàs Cerdà" (UAB)

Posgrado
Presencial
30 Créditos
  • Sant Cugat del Vallès (Barcelona)
2.000 €

Postgrado en Bioinformática: herramientas computacionales en informática médica, ciencias ómicas y diseño de nuevos fármacos

Descripción

Este curso ha sido diseñado por un equipo de profesionales del Sector bioinformática, que han trabajado bajo la coordinación y supervisión del BIB (Bionformatics Barcelona).



Al finalizar el curso, los participantes conocerán y sabrán trabajar con las herramientas computacionales que se utilizan en los proyectos de informática médica. En concreto:

  • Sabrán identificar las fuentes de datos en informática médica, los ámbitos de aplicación en el sector biomédico y agroalimentario,

  • Reconocerá los modelos 3D moleculares en la búsqueda de nuevos fármacos, y las diferentes técnicas de simulación por ordenador en el ámbito de la modelización molecular.

  • Sabrán consultar, modificar y gestionar la información almacenada en:

  • Bases de datos médicos empleando los procedimientos, funciones y guiones incorporados en el lenguaje de manipulación de datos, utilizando servicios desarrollados con la tecnología de la informática en la nube (cloud computing), y utilizando adecuadamente las herramientas y aplicaciones de uso habitual en informática médica.

  • Bases de datos bioinformáticas, empleando los procedimientos, funciones y guiones incorporados en el lenguaje de manipulación de datos ..

  • Bases de datos de estructuras químicas y los datos utilizados para realizar modelizaciones moleculares, empleando los procedimientos, funciones y guiones incorporados en el lenguaje de manipulación de datos.

  • Sabrán trabajar adecuadamente con las herramientas y aplicaciones de uso habitual tanto en ciencias ómicas y como en el diseño de nuevos fármacos.

  • Serán capaces de elaborar informes relacionados con los datos obtenidos a partir de las herramientas utilizadas.


Los participantes en el Curso tendrán acceso al Campus Virtual de las Escuelas Universitarias, donde dispondrán de un conjunto de herramientas de comunicación y colaboración entre participantes y profesorado, además de un repositorio documental.
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Temario

1 Informática médica
1.1 Los datos masivas (Big-fecha) en la investigación biomédica y en la atención sanitaria. Datos médicos de carácter personal. La anonimización de los datos. Legislación en protección de datos.
1.2 Tipos de datos biomédicas. Bases de datos de artículos de científicos.
1.3 Análisis de datos: métodos estadísticos. El entorno de software R. Análisis de datos con R.
2. Herramientas informáticas en investigación biomédica y atención sanitaria:
2.1 Cloud computing. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) y otros.
2.2 Bases de datos de uso habitual en informática médica. PharmGKB, ClinVar-NCBI, OMIM, BioMart, PDB y otros.
2.3 Grabación de resultados y elaboración de informes.
3. Biomoléculas y ciencias ómicas:
3.1 Biomoléculas: desde el ADN a la síntesis de proteínas. Estructura del ADN. Los nucleótidos. Las proteínas. Los aminoácidos. Estructura de las proteínas. Transcripción del ADN. El ARN. Síntesis de proteínas.
3.2 Técnicas de secuenciación del ADN. Comparación de secuencias. Importancia en el estudio del genoma.
3.3 Ciencias ómicas. Genómica. Proteómica y metabolómica. Epigenómica. Interactómica y biología de sistemas. Otras ciencias ómicas. Aplicaciones.
3.4 Sectores de aplicación en el ámbito biomédico y agroalimentario.
4. Herramientas informáticas en las ciencias ómicas:
4.1 Herramientas de uso habitual en genómica. Manipulación de secuencias. Alineación. Acoplamiento de genomas. Anotación de genes. SAMtools, Galaxy y otros.
4.2 Repositorio de herramientas y aplicaciones de uso habitual en ciencias ómicas. Introducción a Bioconductor.
4.3 Aplicación de Bioconductor en las ciencias ómicas: en trancriptómica y en epigenómica.
4.4 Grabación de resultados y elaboración de informes.
5. Los fármacos y los receptores:
5.1 Los fármacos. Finalidades. Formas farmacéuticas y medicamentos.
5.2 Biodisponibilidad y farmacocinética. ADME.
5.4 Estructura de las proteínas.
5.5 Receptores. Interacción fármaco-receptor: agonistas, antagonistas, etc.
5.6 Estructura espacial de las moléculas. Modelos 3D moleculares. Enlaces intermoleculares. Grupos funcionales.
6. Herramientas informáticas en el diseño de nuevos fármacos:
6.1 Bases de datos de estructuras químicas.
6.2 Obtención de datos. Filtrado. Métodos de búsqueda.
6.3 Cribado virtual 2D (virtual screening).
6.4 Herramientas para la búsqueda y el diseño de farmacóforos.
6.5 Herramientas para el acoplamiento molecular (docking): Autodock y AutoGrid.
6.6 Herramientas para simulación de dinámica molecular: Gromacs, Amber y CHARMM.
6.7 Herramientas para el modelado por homología: Swiss-Model.
6.8 Grabación de resultados y elaboración de informes.
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Destinatarios

Dirigido a profesionales del sector Bioinformático, o a personas que por sus inquietudes personales sean consideradas aptas para seguir con normalidad los contenidos.

Requisitos

Para acceder a este curso NO es necesario disponer de titulación universitaria.

Horario/Turno

(Calendario y Horarios pendientes de concretar).

Duración

El curso tiene una duración de 250 horas

Lugar donde se imparte el curso

Sant Cugat

Titulación obtenida

Diploma de Postgrado emitido por Bioinformatics Barcelona y las Escuelas Universitarias Gimbernat y Tomás Cerdá (adscritas a la Universidad Autónoma de Barcelona).

Promociones

Para graduados de Gimbernat, y miembros del BIB, 1700 euros.

Precio

2.000 €

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